jsPhyloSVG

一个圆形的系统发育树jsPhyloSVG是一个用于呈现动态系统发育树的开源解决方案. It 能够生成复杂的和交互的系统发育树在所有主要 无需插件的浏览器. 它在支持解释能力方面是新颖的 树推理直接格式化,将底层标记暴露给数据挖掘 服务. 库源代码、大量文档和实例都是免费的 可以在 www.jsphylosvg.com

Summary

我们提供了一个javascript库jsPhyloSVG,它有助于构建交互式的 直接在浏览器中从原始Newick或phyloXML格式生成系统发育树 可缩放矢量图形(SVG)格式. 它被设计用于所有专业 并为那些不支持的浏览器呈现替代格式 SVG. 该库提供了用于构建矩形和圆形系统图的工具 集成图表. 可以集成交互功能并使其响应 事件,例如单击树的任何元素(包括标签).

Background

已经开发了许多软件包来处理生成系统发育的需要 用于印刷的树木. 随着越来越多地使用网络传播科学 在文献中,系统发育树需要在许多类型中可见 设备和功能的一些互动元素,是不可或缺的浏览 经验. 我们提出了一种新的方法来发布交互系统发育树.

出版

http://www.plosone.org/article/info:doi/10.1371/journal.pone.0012267